孙宇燕 , 陈晓敏 , 王丹丹 , 郭世华

内蒙古农业大学农学院, 呼和浩特, 010019
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 9 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001494
收稿日期: 2014年11月28日    接受日期: 2015年02月13日    发表日期: 2015年06月29日

这是一篇《分子植物育种》印刷版的数字优先出版(Online Publishing in Advance)论文，如果需要下载阅读全文，请您订阅。

推荐引用：

Sun Y.Y., Chen X.M., Wang D.D., and Guo S.H., 2015, Analysis on sequence variation and SNP of waxy gene in spring foxtail millets, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(7): 1494-1501 (孙宇燕, 陈晓敏, 王丹丹, 郭世华, 2015, 春谷子Waxy基因序列变异及其SNP分析, 分子植物育种, 13(7): 1494-1501)

为了明确春谷子Waxy基因序列变异和为品质育种提供实验依据，本研究以引进的15份春谷子为材料，利用特异PCR标记和序列比对，研究了Waxy基因序列单核苷酸多态性。结果表明：引物ex1/TSI2R、M5/M9和ex2int2/ex4在供试15份材料中分别扩增出约380 bp、1 800 bp和1 000 bp的谱带；引物ex1/ex2在利谷21、赤谷4号、A2不育度低和A2-1不育系等4份材料中均未扩增出谱带，在其余11份材料中均扩增出约1 200 bp的谱带；M2/R4在丰田501和金丰谷中未扩增出条带，在其余13份材料中均扩增出约1 500 bp的谱带。与GenBank粳谷KF372879的Waxy基因序列比对，共检测到419个SNPs位点和2 082个氨基酸变异。不同材料之间，总SNPs最多的为赤谷16、赤谷6号和公矮5号，分别为38、37和37，SNPs较少的有赤谷4号和利谷21，均为16；SNP多态性最多的引物为ex1/TSI2R，为159个，最少的为M5/M9，为40个；外显子共检测到47个SNPs，大白毛、A2-1不育系、丰田501、公矮5号和赤谷5号较多，分别为6、5、5、5和5个。非糯、低直链淀粉含量和糯质类型在外显子上的SNP分别为17、22和8个。

春谷子；Waxy基因；序列变异；SNP